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憲兵司令部
陸軍大臣
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└憲兵司令官
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├憲兵司令部総務部長
├憲兵司令部警務部長
├憲兵司令部本部長
├憲兵司令部第一課長(企画課長)･･･警務・教育・編成担当
├憲兵司令部第二課長(警務課長)･･･特高業務担当
├憲兵司令部第三課長(外事課長)･･･防諜・外事・検閲担当
├憲兵司令部庶務課長
├憲兵司令部特務課長･･･軍需生産協力担当
├憲兵司令部総務課長
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（昭和２０年３月１７日改編の憲兵隊編成）勅令憲兵
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├北部憲兵隊司令官─────┬旭川地区憲兵隊長
│ ├函館地区憲兵隊長
│ ├釧路地区憲兵隊長
│ └樺太地区憲兵隊長
├東北憲兵隊司令官─────┬青森地区憲兵隊長
│ ├盛岡地区憲兵隊長
│ ├秋田地区憲兵隊長
│ ├山形地区憲兵隊長
│ └福島地区憲兵隊長
├東部憲兵隊司令官─────┬横浜地区憲兵隊長
│ ├横須賀地区憲兵隊長
│ ├千葉地区憲兵隊長
│ ├甲府地区憲兵隊長
│ ├宇都宮地区憲兵隊長
│ ├浦和地区憲兵隊長
│ ├水戸地区憲兵隊長
│ ├前橋地区憲兵隊長
│ ├新潟地区憲兵隊長
│ └長野地区憲兵隊長
├東海憲兵隊司令官─────┬富山地区憲兵隊長
│ ├岐阜地区憲兵隊長
│ ├静岡地区憲兵隊長
│ ├津地区憲兵隊長
│ └金沢地区憲兵隊長
├中部憲兵隊司令官─────┬大津地区憲兵隊長
│ ├福井地区憲兵隊長
│ ├奈良地区憲兵隊長
│ ├和歌山地区憲兵隊長
│ ├神戸地区憲兵隊長
│ ├京都地区憲兵隊長
│ └舞鶴地区憲兵隊長
├中国憲兵隊司令官─────┬岡山地区憲兵隊長
│ ├鳥取地区憲兵隊長
│ ├呉地区憲兵隊長
│ ├松江地区憲兵隊長
│ └山口地区憲兵隊長
├四国憲兵隊司令官─────┬徳島地区憲兵隊長
│ ├松山地区憲兵隊長
│ └高知地区憲兵隊長
├西部憲兵隊司令官─────┬小倉地区憲兵隊長
│ ├佐賀地区憲兵隊長
│ ├長崎地区憲兵隊長
│ ├佐世保地区憲兵隊長
│ ├熊本地区憲兵隊長
│ ├大分地区憲兵隊長
│ ├宮崎地区憲兵隊長
│ ├鹿児島地区憲兵隊長
│ └沖縄地区憲兵隊長
├特設憲兵隊長
├南洋憲兵隊長
├朝鮮憲兵隊司令官─────┬大正８年に憲兵司令部管轄下に入る
│ ├直轄京城憲兵分隊長
│ ├羅南地区憲兵隊長
│ ├咸興地区憲兵隊長
│ ├新義州地区憲兵隊長
│ ├平壌地区憲兵隊長
│ ├海州地区憲兵隊長
│ ├春川地区憲兵隊長
│ ├清州地区憲兵隊長
│ ├大田地区憲兵隊長
│ ├大邱地区憲兵隊長
│ ├釜山地区憲兵隊長
│ ├全州地区憲兵隊長
│ └光州地区憲兵隊長
├台湾憲兵隊司令官─────┬昭和２０年に憲兵司令部管轄下に入る
│ ├台南地区憲兵隊長
│ └花蓮港地区憲兵隊長
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（昭和２０年３月の改編以前の主要憲兵隊編成）
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├東京憲兵隊長 ├広島憲兵隊長
├旭川憲兵隊長 ├呉憲兵隊長
├札幌憲兵隊長 ├善通寺憲兵隊長
├帯広憲兵隊長 ├久留米憲兵隊長
├樺太憲兵隊長 ├佐世保憲兵隊長
├弘前憲兵隊長 ├熊本憲兵隊長
├仙台憲兵隊長 ├沖縄憲兵隊長
├宇都宮憲兵隊長 ├京城憲兵隊長
├横浜憲兵隊長 ├羅南憲兵隊長
├横須賀憲兵隊長 ├大邱憲兵隊長
├名古屋憲兵隊長 ├咸興憲兵隊長
├舞鶴憲兵隊長 ├光州憲兵隊長
├金沢憲兵隊長 ├平壌憲兵隊長
├京都憲兵隊長 ├台北憲兵隊長
├大阪憲兵隊長 ├台南憲兵隊長
└姫路憲兵隊長 └花蓮港憲兵隊長
戦地憲兵隊(軍令憲兵)
戦地の憲兵隊は各現地軍司令官の管轄下である。
関東憲兵隊司令官─────┬満州事変後に関東軍司令部管轄下に入る
├新京憲兵隊長
├奉天憲兵隊長
├ハルピン憲兵隊長
├チチハル憲兵隊長
├牡丹江憲兵隊長
├錦州憲兵隊長
├承徳憲兵隊長
├延吉憲兵隊長
├間島憲兵隊長
├吉林憲兵隊長
├鶏寧憲兵隊長
├阿爾山憲兵隊長
├興安憲兵隊長
├通化憲兵隊長
├四平憲兵隊長
├鞍山憲兵隊長
├北安憲兵隊長
├孫呉憲兵隊長
├大連憲兵隊長
├チャムス憲兵隊長
├東安憲兵隊長
└ハイラル憲兵隊長
北支那派遣憲兵隊司令官──┬北京憲兵隊長
├天津憲兵隊長
├張家口憲兵隊長
├済南憲兵隊長
├青島憲兵隊長
├開封憲兵隊長
├鄭州憲兵隊長
├太原憲兵隊長
├運城憲兵隊長
├臨汾憲兵隊長
└石門憲兵隊長
中支那派遣憲兵隊司令官──┬上海憲兵隊長
├南京憲兵隊長
├蘇州憲兵隊長
├泰県憲兵隊長
├蘇北憲兵隊長
├漢口憲兵隊長
├九江憲兵隊長
├杭州憲兵隊長
├徐州憲兵隊長
├第６方面軍憲兵隊甲憲兵隊長
└第６方面軍憲兵隊乙憲兵隊長
南支那派遣憲兵隊長
香港占領地総督部──────香港憲兵隊長
南方軍───┬南方軍第１憲兵隊長（仏印）
├南方軍第２憲兵隊長（タイ）
└南方軍第３憲兵隊長（マレー）
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